在學院大力推進畜牧科研的情況下，于2020年底成立了畜牧研究所，主要進行實驗室籌備工作。
畜牧研究所擁有成都農業科技職業學院畜牧研究重點實驗室；國家級課程思政教學名師團隊、國家級在線課程團隊、四川省創新團隊、家禽生態養殖技術推廣協會。擁有FOSS福斯多功能近紅外分析儀NIRS DS 2500F、液相色譜儀、質譜儀、多功能蛋品測試分析儀、蛋殼強度測定儀、蛋殼顏色測定儀（北京亞歐DP-NR）、肉類沃布剪切力嫩度儀、胴體肌肉PH值測定儀、熒光定量 PCR 檢測系統，高通量組織冷凍研磨儀、電泳儀、高速冷凍離心機、酶標儀等儀器設備。
主要從事豬、禽、草食動物、水生動物和桑蠶的營養需要、營養代謝與調控、飼料營養價值評定、飼料加工配制技術、潛在飼料資源開發以及營養與微生態學等的應用型研究。以科研所為基礎，尋求與飼料企業、養殖企業及科研院所開展廣泛的合作研究，奠定畜牧所的科研基礎。承擔經濟動物健康養殖方面的高職?？?、高職本科、海外留學生的人才培養任務。通過對外開放，承接企業委托研發課題，提高產業科技含量，為企業提供個性化技術咨詢與服務等。
畜牧研究所協助相關部門配置研究所前期所需儀器設備及實驗室的規劃;建立畜牧研究所相關管理制度。承接成都市科技局簡陽三里埂扶貧項目；承接江蘇康維生物有限公司“微米低聚糖在家禽飼料中的的應用研究”；發表畜牧研究相關文章2篇,其中SCI1篇；申報發明專利1項，實用新型專利1項；正完成院級重點科研項目1項；家禽創新平臺1個；橫向項目到帳20余萬元。
