動物疫病檢測中心成立于2011年6月，是集學生培養、科技研發、技術服務為一體的開放性平臺， 2014年被四川省動物衛生監督所確定為四川省指定動物檢疫實驗室（川動監〔2014〕62號），2019年被四川省農業農村廳確定為“非洲豬瘟第三方檢測實驗室”（川農函〔2019〕81號），2021年申請備案為四川省動物病原微生物實驗室二級生物安全實驗室（川成動實驗室備字〔003〕號）。
檢測中心建筑面積600余平方米，設立萬級細胞室、十萬級病毒室、細胞培養室、分子生物實驗室等，功能分區完善，檢測中心配備有生物安全柜、熒光定量PCR、超純水系統、超微量分光光度計、倒置熒光顯微鏡、蛋白轉印系統、全自動核酸提取儀、多通道熒光實時定量PCR系統、動物疫病診斷快速檢測儀、超聲波細胞破碎儀、蛋白純化系統等儀器設備300余件（臺、套）。中心有專兼職人員12名，其中教授3名，副教授4人，博士5人，可開展動物疫病診斷與檢測、生物制品研發、食品安全檢測、農牧業技術培訓與服務等工作。近5年中心在科學研究、技術推廣、社會服務、學生科技創新、技能大賽等方面具有顯著成效。
動物疫病檢測中心以服務產業為己任，堅持基礎研究與應用技術研發并重，構建了畜禽疫病防控、生物安全、畜禽健康養殖科技服務團隊，形成了“基礎研究—應用基礎研究—應用研究—社會服務為基本框架的科技創新“研發中心”。開展的科研項目有四川山地烏骨雞“灰羽1號”品種選育，豬病免疫抗體消長動態監測分析、畜禽病原學研究與健康養殖關系分析、豬場生物安全體系建立的分析研究、中藥飼料添加劑在畜禽生產中的研究與應用效果的分析、微生態技術在畜禽健康養殖的應用分析等。承擔省級以上縱向科研項目11項，橫向10項，發明專利8項，成果轉化2項，獲省部級科技獎7項，制定行業標準2項。每年為企業（養殖戶）開展非洲豬瘟病原、包蟲病病原及動物疫病抗原抗體檢測累計13600余份，開展技術講座及指導100余次，社會人員培訓2500余人次。
動物疫病檢測中心還承擔我院大學生創新創業教育工作和技能比賽培訓工作，動物疫病檢測中心遵循“平臺支撐、項目引領、專創融合、技能提升、協同育人、資源共享、持續發展”的原則，堅持立德樹人根本宗旨，以服務學生創新創業實踐和技能提升為導向，推動形成“專業教育+雙創教育+技能提升”深度融合的人才培養新局面。近年來，先后獲得四川省互聯網+創新創業大賽各類獎項13項、“挑戰杯”四川省大學生課外學術科技作品獲獎4項、全國大學生動物防疫技能大賽一等獎4項、四川省大學生技能大賽獲獎5項。
在學術交流方面，中心承辦“四川省非洲豬瘟防控技術交流會”，邀請四川省農業農村廳、四川省動物疫病預防控制中心、四川農業大學、西南民族大學等專家就非洲豬瘟等重大動物疫病防控開展交流；先后與四川省動物疫病預防控制中心、四川農業大學、西南民族大學等科研院所建立了穩定的合作和學術交流。近年來，開展合作研究項目近十項，取得了階段性進展；先后20人次參加國內學術會議。
2018年來，學校先后與四川省動物疫病預防控制中心、溫江區動物疫病預防控制中心、寶興縣動物疫病預防控制中心、天全縣動物疫病預防控制中心等地協同合作，充分利用我中心的人才技術優勢，強化人才培養、技術推廣、科研協作、社會服務等領域的深度合作，有效提升當地動物疫病預防、控制、凈化技術水平，為促進畜牧業生產健康穩定發展，助力鄉村振興發揮積極作用。截至目前，已完成橫向合作項目16項，已完成非洲豬瘟、豬瘟、禽流感、新城疫、小反芻獸疫、馬傳貧、狂犬病、布病、結核病、包蟲病等樣品的檢測及動物疫病預警預報和科學防控技術的制定與實施等，根據當地畜牧業養殖實際，制定科學免疫程序,定期進行免疫工作檢查、免疫效果監測、疫情預警預報，保障畜牧業持續健康發展和公共衛生安全等。已累計完成各類樣品檢測近10萬份（次），到賬經費近50萬元，實現當地畜牧業增加近3000萬元。
